메카트로닉스과는 변화하는 산업추이에 발맞추어 첨단 IT산업과 기계산업의 융합을 통하여 생산자동화를 목표로 하고 있다. 1992년 개설되었으며 1500여명의 졸업생이 배출되어 사회 각층에서 활약하고 있다.

메카트로닉스과에서는 주문식 교육 협약을 체결한 SK 하이닉스를 비롯 삼성전자, LG전자, LG디스플레이와 같은 첨단전자산업의 자동화분야와 반도체설비 및 디스플레이 공정은 물론 삼성바이오로직스, 셀트리온 등 생명 바이오 분야에 다수의 학생들이 취업하고 있으며, 최근에는 현대제철, 동부제철 등 기계 관련업체와 삼성엔지니어링과 같은 설계회사에도 진출하는 등 취업 영역을 넓혀 가고 있다.
또한 2018년부터 현재까지 교육부 사회맞춤형 사업(LINC+)에 참여하며 ㈜ 힘스, ㈜ LSI, ㈜ 숨비 등 첨단 강소 중견기업으로의 실질적인 학생 취업을 위한 산학협력관계를 유지하고 있다. 본과 졸업생들은 기계와 전자, 자동화 관련 전공지식을 기반으로 이론과 실무를 배워 산업현장의 최전선에서 많은 활동을 하고 있다.